Alguns dos problemas mais comumente apresentados pelas pontes Floyd Rose dizem respeito à afinação.

Os modelos que possuem Holder Blocks, com os quais as cordas são travadas no sadle, são mais seguros quanto à afinação, porém outros problemas podem estar afetando o funcionamento do sistema:

1.Os pivôs (que fixam a ponte ao corpo do instrumento), podem estar desalinhados, causando assim um mal funcionamento do sistema.

2.Pode haver um alargamento da cavidade onde se encontra o pivô, o que faz com que o mesmo se movimente e fique também desalinhado, gerando problemas de afinação.

3.Verifique se os parafusos ou as garras apresentam desgastes, o que causa o aparecimento de "degraus" nos mesmos.

4. Os parafusos dos pivôs podem estar com folga, por desgaste, gerando movimentos indesejáveis no sistema.

Em todos os casos acima descritos a ajuda de um Luthier é indispensável, pois esses são apenas alguns dos possíveis problemas encontrados nesse tipo de ponte.